Лучшие музеи Праги посвящены культурному наследию Чехии — шедеврам искусства и науки, Средневековью, мистике, старинным игрушкам, пивным традициям — и часто располагаются в исторических зданиях.
Наиболее масштабные экспозиции вмещают государственные национальные музеи и галереи, городской музей истории, однако в чешской столице немало и выставочных площадок узкой тематики.
Прага обескураживает туристов неожиданными экспозициями. В списке пражских музеев легко обнаружить не только богатые собрания исторических ценностей и картин, выставки чешских писателей и художников, частные коллекции древностей, но и совершенно нетривиальные по своей тематике площадки. Например, в Праге есть музей, полностью посвященный истории Карлова моста, и расположен он соответствующе — у начала моста со стороны Старого Города.
Особенно выделяются музеи, коллекции которых связаны со средневековым наследием, мистикой или мрачными старинными легендами. Главные мистические музеи в Праге: Музей призраков и городских легенд, Музей алхимиков и магов, а также другие специализированные выставочные площадки.
Детских музеев в городе тоже немало — хватит на отдельную тематическую поездку. Юным туристам предлагается посмотреть уникальные экспонаты из «Лего», миниатюры города и железных дорог с поездами, интерактивные иллюзии.
Самую скандальную историю имеет пражский Музей секс-машин, ставший первым в мире музеем данной тематики. Его шокирующая экспозиция различных приспособлений напоминает постоянную выставку Музея пыток.